1.精神、神经因素精神紧张、恐惧、忧虑、环境改变，地区迁移，以及寒冷刺激等，都可导致闭经。由于来自体内外各种刺激引起中枢神经、下丘脑之间功能失调而影响垂体功能，其中黄体生成激素(LH)易受到影响，使排卵功能发生障碍，当抑制程度加剧、卵泡刺激素(FSH)受到影响时，卵泡发育发生障碍而导致闭经。
2.颅内器质疾病变如泌乳素瘤、颅咽管瘤、松果体瘤、丘脑肿瘤、第三脑室肿瘤等;先天性畸形(错构瘤);炎症(如急性软脑膜炎和慢性肉芽肿性损害——结核性脑膜炎);结节病，黄色瘤及组织细胞病等;血管性损害(如出血、梗死、缺血、毛细血管增生及脂肪栓塞等);创伤、变性、血卟啉病，Wernicke综合征(维生素B族缺乏所致脑部出血坏死性损害);以上病变均可导致下丘脑功能紊乱而致闭经。
3.慢性消耗性疾病如慢性肝、肾疾病、结核病、严重贫血以及胃肠功能紊乱等引起的营养不良，都可通过下丘脑影响垂体前叶功能及子宫内膜对性激素的敏感性。又因营养缺乏，可影响垂体前叶对GnH的合成与分泌而致闭经。
4.肥胖生殖无能性营养不良症(dystrophiaadiposo-genital)
由于下丘脑及其周围组织的病变使下丘脑-垂体之间的神经体液联系失常，表现有肥胖、闭经、生殖器官及第二性征发育不全，尿崩症以及智力发育不全或减退等现象。
5.药物影响例如妇女在使用避孕药后少数引起继发闭经，主要对GnRH的暂时性抑制，从而抑制垂体FSH与LH的正常周期性分泌所致。此外，利血平、氯丙嗪、α-甲基多巴等药物亦可导致闭经和溢乳。
6.泌乳闭经综合征由于下丘脑泌乳素释放抑制因子(PIF)分泌减少，致垂体泌乳素(PRL)分泌增多，产生泌乳。因PRL能竞争性地抑制卵巢GnH受体，从而导致闭经，形成闭经-溢乳综合征。
7.多囊卵巢年轻妇女、闭经、不育、多毛、肥胖以及卵巢呈多囊性增大等。
8.其他内分泌腺疾病影响如甲状腺功能减退或亢进、肾上腺皮质功能减退或亢进及糖尿病等，都能通过下丘脑影响垂体GnH的分泌而致闭经。肾上腺性变态综合征中雄激素增多引起闭经。
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